On hyvin tiedossa, että kemikaalit voivat olla haitallisia ympäristölle. Esimerkiksi jotkut aerosolit vahingoittavat otsonikerrosta ja puhdistuskemikaaleissa on terveysvaroituksia, kuten syttyviä, myrkyllisiä. Älä hengitä sisään, juo tai kosketa. Ne voivat myös aiheuttaa allergisia reaktioita, kuten yskää ja ihoärsytystä. Tuoreissa tutkimuksissa on todettu, että säännöllinen altistuminen puhdistusaineille voi vaikuttaa merkittävästi keuhkojen toimintaan. Ne viittaavat siihen, että puhdistusaineiden kemikaalit ärsyttävät limakalvoja keuhkojen hengitysteissä, aiheuttaen pitkäaikaisia vaurioita. Vaikutusten havaittiin myös olevan vakavampia naisilla kuin miehillä.
Hapettamiseen perustuvia kemiallisia valmisteita on kehitetty lukuisia määriä. Natriumhypokloriitti ja vetyperoksidi ovat yleisesti käytettyjä tehoaineita, mutta väkevissä pitoisuuksissa ne ovat vaarallisia ja syövyttäviä. Siksi valmistajat ovat tutkineet ja kehittäneet näille vaihtoehtoisia ainesosia sekä valmisteille ihanteelliset koostumukset muokkaamalla niiden pitoisuuksia sekä tutkineet myös optimaaliset menetelmät, levitystavat, käyttöolosuhteet, vaikutus- ja varoajat.